A medence �ghajlata sz�ls�s�gesen kontinent�lis. Jellemz�je az igen nagy �vi h�m�rs�klet-ingadoz�s, a sz�raz meleg ny�r �s a hossz�, nagyon hideg t�l. A j�liusi k�z�ph�m�rs�klet 20–22 �C, a janu�ri −32-−35 �C; az eddig m�rt legalacsonyabb h�m�rs�klet −55 �C volt. A fagyok 6–7,5 h�napig tartanak. Az �szakr�l �rkez� nedves l�gt�megeket a Tannu-Ola hegyvonulatai feltart�ztatj�k, �gy a csapad�k �vi mennyis�ge a medence alj�n csup�n 150–200 mm, t�bbs�ge ny�ri zivatarok idej�n, a legkevesebb febru�r-m�rciusban hull. A p�rolg�s j�val fel�lm�lja a lehull� csapad�k mennyis�g�t. A teny�szid� (10 �C felett) kora m�just�l szeptember v�g�ig tart.

Nemzetk�zi tudom�nyos program keret�ben 1997 �ta a t�rs�gben az �ghajlatv�ltoz�st, a glob�lis felmeleged�s jelens�g�t vizsg�l� kutat��llom�s m�k�dik.